【文献分享】Nature I Sony SA3800助力探究宿主-微生物间的相互作用

内容摘要

    宿主体内的共生微生物可以影响宿主生理生化的多个方面，但这些影响的分子基础仍然未知。在宿主体内，病原体或共生微生物会与一系列统称为外蛋白（exoproteins）的宿主胞外蛋白和分泌蛋白等相互作用，从而发挥定植、粘附、侵袭、重塑胞外基质和免疫逃逸等各方面的作用，然而外蛋白组与微生物群之间的直接相互作用在很大程度上仍未被探索。如何对数百种微生物菌株的宿主-微生物相互作用进行蛋白质组规模的探索仍然是一项非常有挑战性的科学问题。

    来自美国耶鲁大学的Noah W. Palm和Aaron M. Ring课题组在Nature上发表了研究论文A host–microbiota interactome reveals extensive transkingdom connectivity。在该研究中，作者利用新开发的BASEHIT技术揭示人类外源蛋白质组与微生物组之间的相互作用，并在蛋白组规模上进行了深入的剖析。通过这一创新的方法，科学家们鉴定了超过500种人类中常见微生物与外蛋白的互作图谱，探索了人体内部的特异性菌株互作模式，并发现这些相互作用可能是共生微生物影响人类健康和疾病产生的基础。

主要内容

1.采用BASEHIT技术揭示宿主外蛋白组-微生物组相互作用的图谱

2. 外蛋白相互作用影响细菌定植和疾病调节

3. 外蛋白结合型与非结合型菌株的不同影响

索尼流式亮点

    在本研究中，流式技术发挥了重要作用，研究中涉及的流式检测采用SONY的全光谱流式分析仪SA3800。SA3800采用索尼独创的全光谱检测和分析技术，可以检测真实且完整的全光谱荧光信号，应用光谱解析方法，拆分荧光信号，不需要调节补偿，且具备参照光谱库，可随时反复调用参照光谱，无需反复做单染管。该研究涉及多种样本类型，其中包括不同种类的细胞和细菌，SA3800的独特设计助力研究者高效的检测多种样本类型并提供更客观且准确的流式数据。

总结

     该研究揭示了一个之前未被探索的宿主-菌群分子层面互作景观，这项研究不仅丰富了我们对宿主与微生物组之间关系的理解，更为研究人类健康与疾病之间的微生物组关系提供了重要的线索，为开发新的治疗方法和预防策略提供了有力的科学支持，有望帮助人类更好地应对各种与微生物组相关的健康问题。

参考文献：

Sonnert, Nicole D et al. “A host-microbiota interactome reveals extensive transkingdom connectivity.” Nature vol. 628,8006 (2024): 171-179. doi:10.1038/s41586-024-07162-0