蛋白质样品—质谱鉴定分析

• 蛋白质鉴定是LC-MS的基本应用，即利用质谱完成对样品中未知蛋白质的鉴定/定量分析。

• 蛋白质LC-MS鉴定推荐Co-IP、pull-down等方法纯化/富集的蛋白质复合物，及其他复杂度低的蛋白质样品，如外泌体蛋白（exosome protein）等。

• 样本类型主要分为3类：

• 胶条：考马斯亮蓝染色 (如MGR01：考马斯亮蓝染色) 染色的SDS-PAGE胶条（不推荐银染染色（Silver staining）的胶条 (蛋白质含量太低，质谱前处理和质谱鉴定结果不理想），如以下试剂盒制备的胶条样本：

1. MG01：IP-MS富集试剂盒

2. MG02：SILAC-IP-MS富集试剂盒

• 溶液：如Co-IP富集的蛋白质溶液样本 ，如以下试剂盒制备的溶液样本：

1. MG01：IP-MS富集试剂盒

2. MG02：SILAC-IP-MS富集试剂盒

• Beads：Co-IP/pull-down富集蛋白质的beads (Magnetic beads 或 Agarose beads)，如以下试剂盒制备的beads样本：

1. MG05：SM-PD富集试剂盒 (Biotin tag)

2. MG08：SILAC-SM-PD富集试剂盒（Biotin tag）

3. MG06：SM-PD富集试剂盒 (Alkyne tag)

4. MG09：SILAC-SM-PD富集试剂盒（Alkyne tag）

5. MG07：SM-PD富集试剂盒 (Azide tag)

6. MG10：SILAC-SM-PD富集试剂盒（Azide tag）

• 用户只需提供样品即可，我方完成：（1）样品前处理（酶解生成肽段），（2） 肽段除盐和荧光法精准定量 (Thermo, #23290)，（3）肽段LC-MS（液相色谱-质谱联用）检测，（4）质谱文件检索，完成蛋白质鉴定（定量）等分析，（5）提供完整的英文实验流程，直接用于学术文章提交。

谱璟科技的Protein ID技术流程

• 样品前处理：

1. 对于考染胶条样本：

   使用我司MG03：Co-IP/pull-down胶内酶解试剂盒（IGD）对考染的SDS-PAGE胶条进行（1）脱色、（2）脱水干燥、（3）trypsin 酶解、（4） 肽段提取及冻干、（5）肽段重悬及除盐、（6）除盐肽段荧光法定量(Thermo, #23290)、（7）定量后的除盐肽段冻干。

2. 对于溶液或beads样本：

   使用我司MG04：Co-IP/pull-down溶液酶解试剂盒（ISD）对溶液或beads进行（1）还原、（2）烷基化、（3）trypsin 酶解、（4） 肽段提取及除盐，（5）除盐肽段荧光法定量(Thermo, #23290)、（6）定量后的除盐肽段冻干。
   

• 肽段质谱检测：